RNA Immunoprecipitation(RIP)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能更有效地发现miRNA的调节靶点。RIP技术针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来。之后,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序、芯片等
。(Schematics of RNA-Seq workflow. Wang Y et al., Bioinformatics. 2011)麦特绘谱可提供的技术服务:1)真核有参转录组测序真核生物转录组测序可以分为有参和
有力工具,能更有效地发现miRNA的调节靶点。RIP-seq技术使用特异性抗体对RNA结合蛋白或者特殊修饰的RNA进行免疫共沉淀后,分离纯化RNA,通过高通量测序和分析,深度解析与目标蛋白相互结合的
CLIP- Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunoprecipitation
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ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究新策略
ATAC-Seq由于所需细胞量少,实验简单,可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态,目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。
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